Il Sergente Keroro, comandante dell'unità ricognitiva Grandi Manovre, appartenente alle Forze d'Invasione Spaziali del 58° Pianeta della Galassia Gama, s'infiltra in casa Hinata al fine di iniziare i preparativi preliminari per la conquista della Terra… ma viene subito catturato da Fuyuki e Natsumi. Grazie allo spirito caritatevole di Fuyuki – o, meglio, a causa della sua curiosità – inizia a vivere da parassita a casa Hinata. Successivamente insieme ai suoi quattro sottoposti, Tamama, Giroro, Kururu e Dororo –radunatisi poco alla volta – a volte trama l'invasione del pianeta Pokopen (la Terra), e a volte… no! Dopo aver respinto il plotone di Garuru, inviato dal pianeta madre Keron, i nostri 'eroi' riprendono a condurre una vita oziosa. Ma un certo giorno appare una ragazza misteriosa davanti a Fuyuki, la quale chiama 'padre' un abitante della nebulosa oscura. Qual è il suo obiettivo?!